Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
QSER1Q2KHR3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
QSER1Q2KHR3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
QSER1Q2KHR3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
QSER1Q2KHR3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
QSER1Q2KHR3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
QSER1Q2KHR3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
QSER1Q2KHR3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
QSER1Q2KHR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
QSER1Q2KHR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
QSER1Q2KHR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
QSER1Q2KHR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
QSER1Q2KHR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms