Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RTN1Q16799 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RTN1Q16799 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTN1Q16799 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTN1Q16799 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN1Q16799 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RTN1Q16799 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RTN1Q16799 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTN1Q16799 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RTN1Q16799 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
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