Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
FOXD1Q16676 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
FOXD1Q16676 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
FOXD1Q16676 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FOXD1Q16676 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
FOXD1Q16676 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
FOXD1Q16676 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
FOXD1Q16676 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms