Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO1Q147U7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO1Q147U7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMCO1Q147U7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMCO1Q147U7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMCO1Q147U7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMCO1Q147U7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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