Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.594e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-201ENST00000358855 4422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-212ENST00000481465 728 ntTSL 210.19□□□□□ -0.784e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-205ENST00000431412 836 ntTSL 59.41□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 KIAA0100-209ENST00000580395 577 ntTSL 28.76□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-229ENST00000545558 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.013e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 58.69□□□□□ -1.024e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 P3H1-206ENST00000447502 453 ntTSL 38.49□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.124e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.194e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-210ENST00000463593 1238 ntTSL 57.49□□□□□ -1.213e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-228ENST00000545444 2090 ntTSL 57□□□□□ -1.293e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.334e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.343e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.364e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 YIPF4-202ENST00000437765 728 ntTSL 56.46□□□□□ -1.384e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.44e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.493e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.54e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.514e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.533e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-202ENST00000360868 4341 ntTSL 25.22□□□□□ -1.573e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 KIAA0100-208ENST00000579924 477 ntTSL 34.85□□□□□ -1.634e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-217ENST00000536593 4053 ntTSL 1 (best)4.69□□□□□ -1.663e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NOL8-227ENST00000544867 4598 ntTSL 1 (best)4.28□□□□□ -1.723e-11■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.744e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 CCNY-206ENST00000470025 346 ntTSL 54.1□□□□□ -1.754e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 WDR12-208ENST00000478869 541 ntTSL 24.03□□□□□ -1.764e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 XRCC5-205ENST00000451695 415 ntTSL 52.64□□□□□ -1.994e-6■■■■□ 25.4
PUM1Q14671 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.771e-7■■■■□ 25.3
PUM1Q14671 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.081e-7■■■■□ 25.3
PUM1Q14671 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.763e-15■■■■□ 25.3
PUM1Q14671 ZMAT2-202ENST00000506644 735 ntTSL 38.44□□□□□ -1.063e-15■■■■□ 25.3
PUM1Q14671 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-7■■■■□ 25
PUM1Q14671 PSMD14-205ENST00000492908 1786 ntTSL 24.53□□□□□ -1.683e-6■■■■□ 25
PUM1Q14671 PSMD14-203ENST00000477232 4890 ntTSL 1 (best)2.18□□□□□ -2.063e-6■■■■□ 25
PUM1Q14671 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)16.72■□□□□ 0.275e-12■■■■□ 24.9
PUM1Q14671 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.51e-7■■■■□ 24.9
PUM1Q14671 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.51e-7■■■■□ 24.9
PUM1Q14671 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.471e-7■■■■□ 24.9
PUM1Q14671 MIA3-208ENST00000475451 552 ntTSL 34.94□□□□□ -1.621e-8■■■■□ 24.8
PUM1Q14671 SART1-204ENST00000529532 1471 ntTSL 219.54■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 24.6
PUM1Q14671 MAPK12-210ENST00000497738 2021 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.632e-7■■■■□ 24.6
PUM1Q14671 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 24.6
PUM1Q14671 MAPK12-205ENST00000482969 2101 ntTSL 217.34■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 24.6
PUM1Q14671 MAPK12-208ENST00000496942 2763 ntTSL 216.94■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 24.6
PUM1Q14671 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 24.6
PUM1Q14671 MSL3-208ENST00000421368 795 ntTSL 517.95■□□□□ 0.468e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.758e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.98e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.938e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.948e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-205ENST00000380692 1071 ntTSL 38.99□□□□□ -0.978e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-217ENST00000494268 1124 ntTSL 27.47□□□□□ -1.218e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-215ENST00000482871 834 ntTSL 37.46□□□□□ -1.228e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.258e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-210ENST00000468149 1646 ntTSL 27.02□□□□□ -1.298e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 MSL3-216ENST00000483645 549 ntTSL 45.86□□□□□ -1.478e-7■■■■□ 24.5
PUM1Q14671 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 24.4
PUM1Q14671 USP42-207ENST00000521713 5017 ntTSL 515.46■□□□□ 0.077e-13■■■■□ 24.3
PUM1Q14671 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.067e-13■■■■□ 24.3
PUM1Q14671 USP42-206ENST00000479544 4286 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.377e-13■■■■□ 24.3
PUM1Q14671 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.596e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MMP17-210ENST00000545671 775 ntTSL 324.83■■□□□ 1.576e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.456e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CYTH3-208ENST00000482460 557 ntTSL 323.83■■□□□ 1.416e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.316e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.196e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-210ENST00000565799 716 ntTSL 322.35■■□□□ 1.176e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.146e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-206ENST00000448973 1710 ntTSL 1 (best)22.14■■□□□ 1.146e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.096e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 EHBP1L1-203ENST00000527214 543 ntTSL 221.23■□□□□ 0.996e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.976e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.956e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 EHBP1L1-206ENST00000529596 799 ntTSL 520.95■□□□□ 0.946e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 EHBP1L1-204ENST00000529056 461 ntTSL 220.92■□□□□ 0.946e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.886e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 EHBP1L1-209ENST00000533364 769 ntTSL 220.42■□□□□ 0.866e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.86e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-211ENST00000568077 588 ntTSL 319.9■□□□□ 0.786e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-213ENST00000568830 590 ntTSL 319.9■□□□□ 0.786e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.776e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.776e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.766e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 METTL26-209ENST00000565163 485 ntTSL 319.79■□□□□ 0.766e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-207ENST00000447377 728 ntTSL 219.77■□□□□ 0.766e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MBTPS1-215ENST00000570012 582 ntTSL 519.49■□□□□ 0.716e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TBC1D9B-213ENST00000521669 592 ntTSL 219.38■□□□□ 0.696e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.696e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.696e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.666e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 318.86■□□□□ 0.616e-6■■■■□ 24.2
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 342.5 ms