Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSG2Q14126 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG2Q14126 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG2Q14126 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG2Q14126 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG2Q14126 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG2Q14126 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG2Q14126 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG2Q14126 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG2Q14126 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DSG2Q14126 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSG2Q14126 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
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