Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE2V1Q13404 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE2V1Q13404 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2V1Q13404 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE2V1Q13404 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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