Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRSF5Q13243 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRSF5Q13243 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SRSF5Q13243 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRSF5Q13243 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF5Q13243 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRSF5Q13243 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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