Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms