Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CBX3Q13185 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX3Q13185 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX3Q13185 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX3Q13185 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX3Q13185 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
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