Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4Q12950 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD4Q12950 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD4Q12950 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD4Q12950 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD4Q12950 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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