Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXC1Q12948 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXC1Q12948 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOXC1Q12948 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXC1Q12948 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXC1Q12948 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXC1Q12948 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXC1Q12948 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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