Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXF2Q12947 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXF2Q12947 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXF2Q12947 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXF2Q12947 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
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