Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BPTFQ12830 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BPTFQ12830 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPTFQ12830 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BPTFQ12830 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BPTFQ12830 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
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