Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 NAM8YHR086W 1572 nt9.41□□□□□ -0.9
RKM4Q12504 YKR012CYKR012C 378 nt9.41□□□□□ -0.9
RKM4Q12504 KEL3YPL263C 1956 nt9.41□□□□□ -0.9
RKM4Q12504 VBA3YCL069W 1377 nt9.4□□□□□ -0.9
RKM4Q12504 DLD3YEL071W 1491 nt9.39□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 RIM8YGL045W 1629 nt9.38□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 YOR343CYOR343C 327 nt9.38□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 ERO1YML130C 1692 nt9.38□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 SUV3YPL029W 2214 nt9.37□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 ENO1YGR254W 1314 nt9.37□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 ELO1YJL196C 933 nt9.37□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 REX2YLR059C 810 nt9.37□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 ITR2YOL103W 1830 nt9.36□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 YGR210CYGR210C 1236 nt9.36□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 GID8YMR135C 1368 nt9.36□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 SGA1YIL099W 1650 nt9.36□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 MET1YKR069W 1782 nt9.34□□□□□ -0.91
RKM4Q12504 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.33□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.33□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.33□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.33□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.33□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 YMR265CYMR265C 1386 nt9.33□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 RPL12BYDR418W 498 nt9.32□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 YLR280CYLR280C 351 nt9.32□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 YPL108WYPL108W 507 nt9.32□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 HAP5YOR358W 729 nt9.31□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 snR31snR31 225 nt9.31□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 MRS6YOR370C 1812 nt9.3□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 YKL133CYKL133C 1392 nt9.29□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 HIS2YFR025C 1008 nt9.29□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 YJL160CYJL160C 864 nt9.29□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 YHR219WYHR219W 1875 nt9.28□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 UGP1YKL035W 1500 nt9.28□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 HRA1HRA1 564 nt9.28□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 VMA11YPL234C 495 nt9.28□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 SAN1YDR143C 1833 nt9.28□□□□□ -0.92
RKM4Q12504 ZAP1YJL056C 2643 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 GRH1YDR517W 1119 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 YFR020WYFR020W 699 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 YKL053WYKL053W 375 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 CRC1YOR100C 984 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 REG2YBR050C 1017 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 YGL114WYGL114W 2178 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 SRP54YPR088C 1626 nt9.27□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 LSR1LSR1 1175 nt9.26□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 URH1YDR400W 1023 nt9.25□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 LCP5YER127W 1074 nt9.25□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 RPN14YGL004C 1254 nt9.25□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.25□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 YPT11YNL304W 1254 nt9.25□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 EMC3YKL207W 762 nt9.23□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 ARA2YMR041C 1008 nt9.22□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 FCY1YPR062W 477 nt9.22□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 RSC4YKR008W 1878 nt9.21□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 FRA1YLL029W 2250 nt9.21□□□□□ -0.93
RKM4Q12504 MAS1YLR163C 1389 nt9.21□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 MRP1YDR347W 966 nt9.2□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 YLR122CYLR122C 378 nt9.2□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 EDC2YER035W 438 nt9.19□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 COG1YGL223C 1254 nt9.19□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 YMR166CYMR166C 1107 nt9.18□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 YMR210WYMR210W 1350 nt9.18□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 RPD3YNL330C 1302 nt9.18□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 YPL041CYPL041C 624 nt9.17□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 KGD2YDR148C 1392 nt9.15□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 SNX3YOR357C 489 nt9.15□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 RIM2YBR192W 1134 nt9.15□□□□□ -0.94
RKM4Q12504 PET18YCR020C 648 nt9.14□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.14□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 CWP2YKL096W-A 279 nt9.14□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 YOR268CYOR268C 399 nt9.14□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 SSL2YIL143C 2532 nt9.13□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 YER156CYER156C 1017 nt9.13□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 ADA2YDR448W 1305 nt9.12□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 ODC1YPL134C 933 nt9.12□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 KRR1YCL059C 951 nt9.11□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 GDH1YOR375C 1365 nt9.11□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 FTH1YBR207W 1398 nt9.11□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 GAS1YMR307W 1680 nt9.1□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 SBP1YHL034C 885 nt9.1□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 RSM7YJR113C 744 nt9.1□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 MFG1YDL233W 1377 nt9.1□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 RRT14YIL127C 621 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 LSP1YPL004C 1026 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 YMR209CYMR209C 1374 nt9.09□□□□□ -0.95
RKM4Q12504 PTC6YCR079W 1329 nt9.08□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 TOM20YGR082W 552 nt9.08□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 MCM5YLR274W 2328 nt9.07□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 NAS6YGR232W 687 nt9.07□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 UTR5YEL035C 501 nt9.05□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 CAK1YFL029C 1107 nt9.05□□□□□ -0.96
RKM4Q12504 TAD2YJL035C 753 nt9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms