Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 PAU15YIR041W 375 nt7.53□□□□□ -1.2
RRI1Q12468 NPP2YEL016C 1482 nt7.53□□□□□ -1.2
RRI1Q12468 GNP1YDR508C 1992 nt7.53□□□□□ -1.2
RRI1Q12468 TOM71YHR117W 1920 nt7.52□□□□□ -1.2
RRI1Q12468 UFD1YGR048W 1086 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 YJR154WYJR154W 1041 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.52□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 DUR3YHL016C 2208 nt7.51□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 CSM2YIL132C 642 nt7.51□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 YIL177CYIL177C 5277 nt7.51□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 TUB4YLR212C 1422 nt7.51□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 FIT1YDR534C 1587 nt7.5□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 YDR467CYDR467C 327 nt7.49□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 KRE1YNL322C 942 nt7.49□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 NSG2YNL156C 900 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 LEU2YCL018W 1095 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 SUV3YPL029W 2214 nt7.48□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 SWT21YNL187W 1074 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 ORT1YOR130C 879 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 Q0010Q0010 387 nt7.47□□□□□ -1.21
RRI1Q12468 RAD51YER095W 1203 nt7.46□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.46□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 PAU5YFL020C 369 nt7.45□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 STP3YLR375W 1032 nt7.45□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 TRP2YER090W 1524 nt7.45□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 PAR32YDL173W 888 nt7.44□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 TPC1YGR096W 945 nt7.44□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 CRC1YOR100C 984 nt7.44□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 MET1YKR069W 1782 nt7.43□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 THI6YPL214C 1623 nt7.43□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 NIF3YGL221C 867 nt7.43□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 DUS3YLR401C 2007 nt7.42□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 HXT11YOL156W 1704 nt7.42□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 ALR1YOL130W 2580 nt7.42□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 SFL1YOR140W 2301 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 PUS7YOR243C 2031 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 ESS1YJR017C 513 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 APS2YJR058C 444 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 FSH2YMR222C 672 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 SPE2YOL052C 1191 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 snR4snR4 186 nt7.41□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 POP2YNR052C 1302 nt7.4□□□□□ -1.22
RRI1Q12468 ADE16YLR028C 1776 nt7.39□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 LPD1YFL018C 1500 nt7.39□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 EMC3YKL207W 762 nt7.39□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 NAM8YHR086W 1572 nt7.38□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 THP3YPR045C 1413 nt7.38□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 PGC1YPL206C 966 nt7.38□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 SBP1YHL034C 885 nt7.37□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 YKL053WYKL053W 375 nt7.37□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 YBL095WYBL095W 813 nt7.37□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 SRP54YPR088C 1626 nt7.37□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 KGD2YDR148C 1392 nt7.36□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 AAT1YKL106W 1356 nt7.35□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 GPM1YKL152C 744 nt7.35□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 REX2YLR059C 810 nt7.35□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 YPT11YNL304W 1254 nt7.35□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 YBR232CYBR232C 360 nt7.35□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 SRM1YGL097W 1449 nt7.35□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 SAN1YDR143C 1833 nt7.34□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 GGA2YHR108W 1758 nt7.34□□□□□ -1.23
RRI1Q12468 IGD1YFR017C 588 nt7.33□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 YMC2YBR104W 990 nt7.33□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 YLR173WYLR173W 1827 nt7.32□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 YKR012CYKR012C 378 nt7.32□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 RTG2YGL252C 1767 nt7.31□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 NAS2YIL007C 663 nt7.31□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 GAS1YMR307W 1680 nt7.31□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 YMR210WYMR210W 1350 nt7.31□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 FTH1YBR207W 1398 nt7.31□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 PFS2YNL317W 1398 nt7.3□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.29□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.29□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.29□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 DIA4YHR011W 1341 nt7.28□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 LYS20YDL182W 1287 nt7.28□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 RSM7YJR113C 744 nt7.28□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 PTC6YCR079W 1329 nt7.27□□□□□ -1.24
RRI1Q12468 ENO1YGR254W 1314 nt7.27□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 SDS24YBR214W 1584 nt7.26□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 SEN2YLR105C 1134 nt7.26□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.26□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 YLR072WYLR072W 2082 nt7.26□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 MET30YIL046W 1923 nt7.25□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 MOB1YIL106W 945 nt7.25□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 NAP1YKR048C 1254 nt7.25□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 HSV2YGR223C 1347 nt7.25□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 THI3YDL080C 1830 nt7.24□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 MRS4YKR052C 915 nt7.24□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 ADH3YMR083W 1128 nt7.24□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 FLX1YIL134W 936 nt7.23□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 CYC3YAL039C 810 nt7.23□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 CDD1YLR245C 429 nt7.23□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 MDH2YOL126C 1134 nt7.23□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 IPL1YPL209C 1104 nt7.23□□□□□ -1.25
RRI1Q12468 PAB1YER165W 1734 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.9 ms