Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 THI3YDL080C 1830 nt7.83□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 TVP23YDR084C 600 nt7.83□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 UFD1YGR048W 1086 nt7.83□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 GLR1YPL091W 1452 nt7.82□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 YMC2YBR104W 990 nt7.82□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 KGD2YDR148C 1392 nt7.82□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 YLR072WYLR072W 2082 nt7.82□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 GGA2YHR108W 1758 nt7.8□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 POP2YNR052C 1302 nt7.79□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.79□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 YMR210WYMR210W 1350 nt7.79□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 GCD11YER025W 1584 nt7.79□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 YPI1YFR003C 468 nt7.78□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 FTH1YBR207W 1398 nt7.78□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 ADE16YLR028C 1776 nt7.78□□□□□ -1.16
RBD2Q12270 YMR226CYMR226C 804 nt7.77□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 YKL053WYKL053W 375 nt7.76□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 YIL177CYIL177C 5277 nt7.75□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 SPS100YHR139C 981 nt7.75□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 SNZ1YMR096W 894 nt7.75□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 YPR126CYPR126C 309 nt7.75□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 MAM3YOL060C 2121 nt7.75□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 SBP1YHL034C 885 nt7.74□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 MRS4YKR052C 915 nt7.74□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 ESS1YJR017C 513 nt7.73□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 DIA4YHR011W 1341 nt7.73□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 SAN1YDR143C 1833 nt7.73□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.72□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.72□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.72□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 LEA1YPL213W 717 nt7.72□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 AMF1YOR378W 1548 nt7.72□□□□□ -1.17
RBD2Q12270 snR86snR86 1004 nt7.71□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 YEL023CYEL023C 2049 nt7.71□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 YNR029CYNR029C 1290 nt7.7□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 AAC3YBR085W 924 nt7.7□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 Q0010Q0010 387 nt7.7□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 ABZ2YMR289W 1125 nt7.69□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 LPD1YFL018C 1500 nt7.68□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 YJL045WYJL045W 1905 nt7.68□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 IML3YBR107C 738 nt7.68□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 PFS2YNL317W 1398 nt7.68□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 ABP1YCR088W 1779 nt7.67□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 ENO2YHR174W 1314 nt7.67□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 CTI6YPL181W 1521 nt7.65□□□□□ -1.18
RBD2Q12270 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.65□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.65□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.65□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 HSV2YGR223C 1347 nt7.64□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 MDH2YOL126C 1134 nt7.64□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 ALR1YOL130W 2580 nt7.64□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 HIS3YOR202W 663 nt7.63□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 CCT5YJR064W 1689 nt7.63□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 TMS1YDR105C 1422 nt7.62□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 SRP54YPR088C 1626 nt7.62□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 ADH1YOL086C 1047 nt7.61□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 GAS1YMR307W 1680 nt7.6□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 SLM3YDL033C 1254 nt7.59□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 STF1YDL130W-A 261 nt7.59□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 TPC1YGR096W 945 nt7.59□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 LEU2YCL018W 1095 nt7.59□□□□□ -1.19
RBD2Q12270 PTC6YCR079W 1329 nt7.58□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 PMT7YDR307W 1989 nt7.58□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 ECM10YEL030W 1935 nt7.58□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 NAM8YHR086W 1572 nt7.58□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 PAR32YDL173W 888 nt7.57□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 LYS20YDL182W 1287 nt7.56□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 YJL009WYJL009W 327 nt7.55□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 NDE2YDL085W 1638 nt7.55□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 YBR056WYBR056W 1506 nt7.54□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 REX2YLR059C 810 nt7.54□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 YNL190WYNL190W 615 nt7.54□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 MHF1YOL086W-A 273 nt7.54□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 ECM27YJR106W 2178 nt7.54□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 MET30YIL046W 1923 nt7.54□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 GUT1YHL032C 2130 nt7.52□□□□□ -1.2
RBD2Q12270 RBG2YGR173W 1107 nt7.52□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 TIF3YPR163C 1311 nt7.52□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 MEP1YGR121C 1479 nt7.51□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 AIM34YMR003W 597 nt7.51□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 YPT11YNL304W 1254 nt7.5□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 YNL140CYNL140C 570 nt7.49□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 LAS17YOR181W 1902 nt7.48□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 MRN1YPL184C 1839 nt7.48□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.48□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.48□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 ITR1YDR497C 1755 nt7.47□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 BUD31YCR063W 474 nt7.47□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 GLY1YEL046C 1164 nt7.47□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 YJR149WYJR149W 1215 nt7.47□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 PRC1YMR297W 1599 nt7.46□□□□□ -1.21
RBD2Q12270 BUB2YMR055C 921 nt7.46□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 INO1YJL153C 1602 nt7.45□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 YHR131CYHR131C 2553 nt7.45□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 POT1YIL160C 1254 nt7.45□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 YIR035CYIR035C 765 nt7.45□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 MET13YGL125W 1803 nt7.45□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 WSC4YHL028W 1818 nt7.45□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 INM1YHR046C 888 nt7.44□□□□□ -1.22
RBD2Q12270 LRO1YNR008W 1986 nt7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms