Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 PTC6YCR079W 1329 nt9.78□□□□□ -0.84
RIM20Q12033 GAS1YMR307W 1680 nt9.77□□□□□ -0.84
RIM20Q12033 YCR025CYCR025C 411 nt9.77□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 SLG1YOR008C 1137 nt9.77□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 AGP3YFL055W 1677 nt9.77□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 GPM1YKL152C 744 nt9.76□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 CYT1YOR065W 930 nt9.76□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 ENO1YGR254W 1314 nt9.75□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.74□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.74□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.74□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 YPT11YNL304W 1254 nt9.74□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 MAE1YKL029C 2010 nt9.73□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 GGA2YHR108W 1758 nt9.73□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 ACO2YJL200C 2370 nt9.73□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 CYC3YAL039C 810 nt9.72□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 NPP2YEL016C 1482 nt9.72□□□□□ -0.85
RIM20Q12033 INH1YDL181W 258 nt9.71□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 LYS20YDL182W 1287 nt9.71□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 YFR020WYFR020W 699 nt9.69□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 YLR280CYLR280C 351 nt9.69□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 SER2YGR208W 930 nt9.68□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 YBL095WYBL095W 813 nt9.67□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 SRP102YKL154W 735 nt9.66□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 ERO1YML130C 1692 nt9.66□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 FRE6YLL051C 2139 nt9.65□□□□□ -0.86
RIM20Q12033 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.64□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.64□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.64□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.64□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.64□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 SAM50YNL026W 1455 nt9.64□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 RSM7YJR113C 744 nt9.63□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 YMC2YBR104W 990 nt9.63□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 SWM1YDR260C 513 nt9.6□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 YGR210CYGR210C 1236 nt9.6□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 HTS1YPR033C 1641 nt9.6□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 YCP4YCR004C 744 nt9.59□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 AAC3YBR085W 924 nt9.59□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 AAT1YKL106W 1356 nt9.59□□□□□ -0.87
RIM20Q12033 MTO1YGL236C 2010 nt9.57□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 MRS4YKR052C 915 nt9.57□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 FET5YFL041W 1869 nt9.55□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 FCY1YPR062W 477 nt9.55□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 TMS1YDR105C 1422 nt9.54□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 TPN1YGL186C 1740 nt9.53□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 YHL008CYHL008C 1884 nt9.53□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 TRP2YER090W 1524 nt9.52□□□□□ -0.88
RIM20Q12033 YPL108WYPL108W 507 nt9.52□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 YJR149WYJR149W 1215 nt9.51□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 TPO4YOR273C 1980 nt9.51□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 NBA1YOL070C 1506 nt9.51□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 MET22YOL064C 1074 nt9.5□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 THI6YPL214C 1623 nt9.49□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 snR86snR86 1004 nt9.49□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 YLR460CYLR460C 1131 nt9.49□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 RNA170RNA170 169 nt9.49□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 YJL009WYJL009W 327 nt9.48□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 YMR166CYMR166C 1107 nt9.48□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 MEP1YGR121C 1479 nt9.47□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 EMC3YKL207W 762 nt9.47□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 LSP1YPL004C 1026 nt9.47□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 YBR056WYBR056W 1506 nt9.46□□□□□ -0.89
RIM20Q12033 YIR035CYIR035C 765 nt9.46□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 OCH1YGL038C 1443 nt9.46□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 CAK1YFL029C 1107 nt9.45□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 CHS7YHR142W 951 nt9.45□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 BUB2YMR055C 921 nt9.45□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 HXT11YOL156W 1704 nt9.45□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 YLR072WYLR072W 2082 nt9.44□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 PET18YCR020C 648 nt9.44□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 YMR007WYMR007W 381 nt9.44□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 YJL160CYJL160C 864 nt9.43□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 PDC6YGR087C 1692 nt9.42□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 OLA1YBR025C 1185 nt9.41□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 YIA6YIL006W 1122 nt9.4□□□□□ -0.9
RIM20Q12033 SRM1YGL097W 1449 nt9.39□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 RRT14YIL127C 621 nt9.37□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 SOD2YHR008C 702 nt9.36□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 YMR210WYMR210W 1350 nt9.36□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 ABP1YCR088W 1779 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 RIB1YBL033C 1038 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 RCR1YBR005W 642 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 RHO1YPR165W 630 nt9.35□□□□□ -0.91
RIM20Q12033 SHC1YER096W 1539 nt9.35□□□□□ -0.91
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