Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ZNF543Q08ER8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZNF543Q08ER8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNF543Q08ER8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZNF543Q08ER8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZNF543Q08ER8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ZNF543Q08ER8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms