Protein–RNA interactions for Protein: Q08965

BMS1, Ribosome biogenesis protein BMS1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BMS1Q08965 RPN14YGL004C 1254 nt10.41□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 FRE6YLL051C 2139 nt10.41□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 YLR280CYLR280C 351 nt10.41□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 RPD3YNL330C 1302 nt10.4□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.4□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.4□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.4□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.4□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.4□□□□□ -0.74
BMS1Q08965 SAN1YDR143C 1833 nt10.4□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 ERO1YML130C 1692 nt10.38□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 YGR210CYGR210C 1236 nt10.38□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 SRP102YKL154W 735 nt10.38□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 YMR007WYMR007W 381 nt10.38□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 RIM2YBR192W 1134 nt10.38□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 KGD2YDR148C 1392 nt10.38□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 URA8YJR103W 1737 nt10.36□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 HIS2YFR025C 1008 nt10.36□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 YER152W-AYER152W-A 567 nt10.35□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 FCY1YPR062W 477 nt10.35□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 SSL2YIL143C 2532 nt10.34□□□□□ -0.75
BMS1Q08965 POP2YNR052C 1302 nt10.33□□□□□ -0.76
BMS1Q08965 YFR020WYFR020W 699 nt10.32□□□□□ -0.76
BMS1Q08965 YPT11YNL304W 1254 nt10.29□□□□□ -0.76
BMS1Q08965 RCR1YBR005W 642 nt10.29□□□□□ -0.76
BMS1Q08965 CWP2YKL096W-A 279 nt10.27□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 YPL108WYPL108W 507 nt10.27□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 PTC6YCR079W 1329 nt10.27□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 YHL008CYHL008C 1884 nt10.26□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 GAS1YMR307W 1680 nt10.26□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 ODC1YPL134C 933 nt10.26□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 RPC31YNL151C 756 nt10.25□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 DPL1YDR294C 1770 nt10.24□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 GID7YCL039W 2238 nt10.24□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 SBP1YHL034C 885 nt10.24□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 BUD20YLR074C 501 nt10.22□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 YJL160CYJL160C 864 nt10.21□□□□□ -0.77
BMS1Q08965 KRR1YCL059C 951 nt10.2□□□□□ -0.78
BMS1Q08965 RSM7YJR113C 744 nt10.18□□□□□ -0.78
BMS1Q08965 EMC3YKL207W 762 nt10.18□□□□□ -0.78
BMS1Q08965 LSP1YPL004C 1026 nt10.18□□□□□ -0.78
BMS1Q08965 YMR210WYMR210W 1350 nt10.15□□□□□ -0.78
BMS1Q08965 THI3YDL080C 1830 nt10.15□□□□□ -0.78
BMS1Q08965 PET18YCR020C 648 nt10.14□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 YMR166CYMR166C 1107 nt10.14□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 PAU21YOR394W 495 nt10.14□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 PAU22YPL282C 495 nt10.14□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 GRH1YDR517W 1119 nt10.13□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 MDM35YKL053C-A 261 nt10.12□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.12□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 GGA2YHR108W 1758 nt10.11□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 PSD1YNL169C 1503 nt10.11□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 LEU4YNL104C 1860 nt10.1□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 YOR343CYOR343C 327 nt10.09□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 GTB1YDR221W 2109 nt10.09□□□□□ -0.79
BMS1Q08965 CAK1YFL029C 1107 nt10.08□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 GPM1YKL152C 744 nt10.08□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 YLR460CYLR460C 1131 nt10.07□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 MET22YOL064C 1074 nt10.07□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 BSP1YPR171W 1731 nt10.07□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 OCH1YGL038C 1443 nt10.06□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 YDR467CYDR467C 327 nt10.05□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 UTR5YEL035C 501 nt10.05□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 HRA1HRA1 564 nt10.05□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 RRT14YIL127C 621 nt10.05□□□□□ -0.8
BMS1Q08965 RNA170RNA170 169 nt10.02□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 DMA2YNL116W 1569 nt10.01□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 CHS7YHR142W 951 nt10.01□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 YJR149WYJR149W 1215 nt10.01□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 HXK1YFR053C 1458 nt10.01□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 ALD5YER073W 1563 nt10.01□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 ESBP6YNL125C 2022 nt10□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 MRP1YDR347W 966 nt10□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 PDC6YGR087C 1692 nt9.99□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.99□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.99□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.99□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 ADA2YDR448W 1305 nt9.99□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 YER156CYER156C 1017 nt9.98□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 HXT10YFL011W 1641 nt9.97□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 MFT1YML062C 1179 nt9.97□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 OLA1YBR025C 1185 nt9.97□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 RPS6AYPL090C 711 nt9.97□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 RPS6BYBR181C 711 nt9.97□□□□□ -0.81
BMS1Q08965 RPL12BYDR418W 498 nt9.96□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 BXI1YNL305C 894 nt9.96□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 AAC3YBR085W 924 nt9.96□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 GDH1YOR375C 1365 nt9.96□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 YBL095WYBL095W 813 nt9.95□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.94□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.94□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.94□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.94□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.94□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.94□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.94□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 YMC2YBR104W 990 nt9.93□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 NPP2YEL016C 1482 nt9.92□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 TMS1YDR105C 1422 nt9.92□□□□□ -0.82
BMS1Q08965 INH1YDL181W 258 nt9.92□□□□□ -0.82
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