Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 SDS24YBR214W 1584 nt7.38□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 ENO1YGR254W 1314 nt7.38□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 CYC3YAL039C 810 nt7.37□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 DPL1YDR294C 1770 nt7.37□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 NPP1YCR026C 2229 nt7.37□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 YDR467CYDR467C 327 nt7.36□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 INH1YDL181W 258 nt7.35□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 PSD1YNL169C 1503 nt7.35□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 GAS1YMR307W 1680 nt7.35□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 VBA3YCL069W 1377 nt7.34□□□□□ -1.23
NIP7Q08962 PTC6YCR079W 1329 nt7.33□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 RSM7YJR113C 744 nt7.33□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 SLG1YOR008C 1137 nt7.33□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 LYS20YDL182W 1287 nt7.32□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 GGA2YHR108W 1758 nt7.32□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 LEU4YNL104C 1860 nt7.32□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 GPM1YKL152C 744 nt7.31□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 SRP102YKL154W 735 nt7.31□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 HXT10YFL011W 1641 nt7.3□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 YLR280CYLR280C 351 nt7.3□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 SER2YGR208W 930 nt7.29□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 BSP1YPR171W 1731 nt7.28□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 YCP4YCR004C 744 nt7.28□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 YBL095WYBL095W 813 nt7.28□□□□□ -1.24
NIP7Q08962 HTS1YPR033C 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 ERO1YML130C 1692 nt7.27□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 YHR218WYHR218W 1812 nt7.27□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 SAM50YNL026W 1455 nt7.26□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 YFR020WYFR020W 699 nt7.26□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.26□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 YMC2YBR104W 990 nt7.26□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 THI3YDL080C 1830 nt7.26□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.25□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.25□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 AGP3YFL055W 1677 nt7.25□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 YLR460CYLR460C 1131 nt7.24□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 YGR210CYGR210C 1236 nt7.22□□□□□ -1.25
NIP7Q08962 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.21□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.21□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.21□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.21□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.21□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 MRS4YKR052C 915 nt7.21□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 HMG2YLR450W 3138 nt7.21□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 NPP2YEL016C 1482 nt7.2□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 FCY1YPR062W 477 nt7.2□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 CHS7YHR142W 951 nt7.19□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 YMR007WYMR007W 381 nt7.19□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 MAE1YKL029C 2010 nt7.18□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 SWM1YDR260C 513 nt7.18□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 YIR035CYIR035C 765 nt7.18□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 RCR1YBR005W 642 nt7.18□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 AAC3YBR085W 924 nt7.18□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 TPO4YOR273C 1980 nt7.18□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 TMS1YDR105C 1422 nt7.18□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 YIA6YIL006W 1122 nt7.17□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 YJL009WYJL009W 327 nt7.17□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 OLA1YBR025C 1185 nt7.17□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 AAT1YKL106W 1356 nt7.17□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 YPL108WYPL108W 507 nt7.16□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 TPN1YGL186C 1740 nt7.15□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 ESBP6YNL125C 2022 nt7.15□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 YJR149WYJR149W 1215 nt7.15□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 YMR166CYMR166C 1107 nt7.15□□□□□ -1.26
NIP7Q08962 BUB2YMR055C 921 nt7.14□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 RIB1YBL033C 1038 nt7.13□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 LSP1YPL004C 1026 nt7.13□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.12□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.12□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.12□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 MTO1YGL236C 2010 nt7.12□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 SOD2YHR008C 702 nt7.12□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 MET22YOL064C 1074 nt7.11□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 OCH1YGL038C 1443 nt7.1□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 ILV2YMR108W 2064 nt7.1□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 NBA1YOL070C 1506 nt7.1□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 CAK1YFL029C 1107 nt7.09□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 RRT14YIL127C 621 nt7.09□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 YIL177CYIL177C 5277 nt7.09□□□□□ -1.27
NIP7Q08962 snR86snR86 1004 nt7.08□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 EMC3YKL207W 762 nt7.08□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 YBR056WYBR056W 1506 nt7.06□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 PDC6YGR087C 1692 nt7.06□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 TRP2YER090W 1524 nt7.06□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 THI6YPL214C 1623 nt7.05□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 YHL008CYHL008C 1884 nt7.05□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 URA8YJR103W 1737 nt7.05□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 YPT31YER031C 672 nt7.05□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 YJL160CYJL160C 864 nt7.05□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 GTB1YDR221W 2109 nt7.04□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 ERG6YML008C 1152 nt7.04□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 RNA170RNA170 169 nt7.04□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 RHO1YPR165W 630 nt7.04□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 YPR084WYPR084W 1371 nt7.03□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 MEP1YGR121C 1479 nt7.03□□□□□ -1.28
NIP7Q08962 YMR206WYMR206W 942 nt7.02□□□□□ -1.29
NIP7Q08962 YMR210WYMR210W 1350 nt7.02□□□□□ -1.29
NIP7Q08962 FET5YFL041W 1869 nt7.02□□□□□ -1.29
NIP7Q08962 RFC1YOR217W 2586 nt7.02□□□□□ -1.29
NIP7Q08962 MFT1YML062C 1179 nt7.01□□□□□ -1.29
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