Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCK1Q08629 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPOCK1Q08629 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCK1Q08629 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK1Q08629 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms