Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FMODQ06828 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FMODQ06828 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FMODQ06828 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FMODQ06828 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FMODQ06828 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FMODQ06828 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FMODQ06828 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FMODQ06828 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FMODQ06828 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FMODQ06828 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FMODQ06828 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FMODQ06828 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FMODQ06828 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FMODQ06828 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FMODQ06828 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FMODQ06828 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FMODQ06828 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FMODQ06828 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FMODQ06828 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FMODQ06828 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FMODQ06828 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FMODQ06828 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FMODQ06828 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FMODQ06828 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FMODQ06828 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FMODQ06828 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FMODQ06828 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FMODQ06828 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FMODQ06828 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FMODQ06828 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FMODQ06828 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FMODQ06828 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FMODQ06828 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FMODQ06828 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FMODQ06828 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FMODQ06828 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FMODQ06828 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FMODQ06828 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FMODQ06828 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FMODQ06828 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FMODQ06828 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FMODQ06828 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FMODQ06828 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FMODQ06828 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FMODQ06828 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FMODQ06828 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FMODQ06828 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FMODQ06828 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FMODQ06828 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FMODQ06828 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FMODQ06828 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FMODQ06828 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FMODQ06828 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FMODQ06828 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FMODQ06828 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FMODQ06828 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FMODQ06828 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FMODQ06828 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FMODQ06828 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FMODQ06828 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FMODQ06828 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FMODQ06828 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FMODQ06828 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FMODQ06828 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FMODQ06828 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FMODQ06828 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FMODQ06828 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FMODQ06828 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FMODQ06828 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FMODQ06828 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FMODQ06828 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FMODQ06828 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FMODQ06828 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FMODQ06828 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FMODQ06828 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FMODQ06828 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FMODQ06828 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FMODQ06828 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FMODQ06828 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FMODQ06828 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FMODQ06828 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FMODQ06828 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FMODQ06828 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FMODQ06828 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FMODQ06828 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FMODQ06828 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FMODQ06828 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FMODQ06828 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FMODQ06828 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FMODQ06828 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FMODQ06828 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FMODQ06828 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FMODQ06828 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FMODQ06828 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FMODQ06828 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FMODQ06828 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms