Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBQ06643 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBQ06643 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LTBQ06643 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBQ06643 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTBQ06643 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBQ06643 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBQ06643 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBQ06643 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTBQ06643 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBQ06643 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBQ06643 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTBQ06643 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBQ06643 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBQ06643 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBQ06643 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTBQ06643 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LTBQ06643 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBQ06643 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTBQ06643 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBQ06643 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBQ06643 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTBQ06643 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBQ06643 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBQ06643 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LTBQ06643 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBQ06643 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTBQ06643 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBQ06643 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBQ06643 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBQ06643 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBQ06643 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTBQ06643 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBQ06643 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBQ06643 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBQ06643 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTBQ06643 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTBQ06643 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBQ06643 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBQ06643 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBQ06643 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTBQ06643 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBQ06643 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBQ06643 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBQ06643 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LTBQ06643 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBQ06643 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBQ06643 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTBQ06643 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBQ06643 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTBQ06643 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBQ06643 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBQ06643 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBQ06643 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBQ06643 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBQ06643 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBQ06643 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTBQ06643 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBQ06643 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LTBQ06643 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBQ06643 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBQ06643 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBQ06643 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBQ06643 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTBQ06643 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBQ06643 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBQ06643 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBQ06643 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTBQ06643 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBQ06643 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBQ06643 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBQ06643 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTBQ06643 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBQ06643 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBQ06643 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBQ06643 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBQ06643 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTBQ06643 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBQ06643 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBQ06643 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBQ06643 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTBQ06643 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTBQ06643 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTBQ06643 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBQ06643 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBQ06643 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBQ06643 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBQ06643 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBQ06643 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTBQ06643 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBQ06643 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBQ06643 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms