Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 SFP1YLR403W 2052 nt8.95□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 HIS2YFR025C 1008 nt8.95□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 YJL055WYJL055W 738 nt8.95□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 TAT2YOL020W 1779 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 MAF1YDR005C 1188 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 ATP6Q0085 780 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 RUF21RUF21 707 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 YPL277CYPL277C 1464 nt8.94□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 YIL092WYIL092W 1902 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 SOL2YCR073W-A 948 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 VRG4YGL225W 1014 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 RPT5YOR117W 1305 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 DIG1YPL049C 1359 nt8.93□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 MRPL24YMR193W 777 nt8.91□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 HXT12YIL170W 1374 nt8.9□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 EAF3YPR023C 1206 nt8.9□□□□□ -0.98
HDA3Q06623 OYE2YHR179W 1203 nt8.89□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 AIM1YAL046C 357 nt8.89□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 STE4YOR212W 1272 nt8.89□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 TPS1YBR126C 1488 nt8.89□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 Q0255Q0255 1419 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 GID8YMR135C 1368 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 YDR455CYDR455C 309 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 PTC7YHR076W 1032 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 RIB2YOL066C 1776 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 NPP1YCR026C 2229 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 MLS1YNL117W 1665 nt8.88□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 EHD3YDR036C 1503 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 YPR1YDR368W 939 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 FUN14YAL008W 597 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 TSR2YLR435W 618 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 GPN2YOR262W 1044 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 MAE1YKL029C 2010 nt8.87□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 YPI1YFR003C 468 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 ELO1YJL196C 933 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 ZAP1YJL056C 2643 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 YMR209CYMR209C 1374 nt8.86□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 BUD31YCR063W 474 nt8.85□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 LSM5YER146W 282 nt8.85□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 YJL195CYJL195C 702 nt8.85□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 YGL188CYGL188C 174 nt8.84□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 DBR1YKL149C 1218 nt8.84□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 NMD4YLR363C 657 nt8.84□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 CBK1YNL161W 2271 nt8.84□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 MRS6YOR370C 1812 nt8.84□□□□□ -0.99
HDA3Q06623 ISR1YPR106W 1332 nt8.83□□□□□ -1
HDA3Q06623 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt8.83□□□□□ -1
HDA3Q06623 SPC24YMR117C 642 nt8.83□□□□□ -1
HDA3Q06623 GAL3YDR009W 1563 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 YDL158CYDL158C 309 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 RAD51YER095W 1203 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 DDI1YER143W 1287 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 Q0142Q0142 177 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 YNR029CYNR029C 1290 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 FES1YBR101C 873 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 YKL133CYKL133C 1392 nt8.82□□□□□ -1
HDA3Q06623 MAD2YJL030W 591 nt8.81□□□□□ -1
HDA3Q06623 PEX22YAL055W 543 nt8.81□□□□□ -1
HDA3Q06623 YLR046CYLR046C 813 nt8.81□□□□□ -1
HDA3Q06623 REX3YLR107W 1215 nt8.81□□□□□ -1
HDA3Q06623 YOL079WYOL079W 399 nt8.81□□□□□ -1
HDA3Q06623 YLR349WYLR349W 507 nt8.8□□□□□ -1
HDA3Q06623 ADH1YOL086C 1047 nt8.8□□□□□ -1
HDA3Q06623 RIB7YBR153W 735 nt8.8□□□□□ -1
HDA3Q06623 YHR219WYHR219W 1875 nt8.8□□□□□ -1
HDA3Q06623 ADH7YCR105W 1086 nt8.79□□□□□ -1
HDA3Q06623 GTT3YEL017W 1014 nt8.79□□□□□ -1
HDA3Q06623 ENT4YLL038C 744 nt8.79□□□□□ -1
HDA3Q06623 TAF11YML015C 1041 nt8.79□□□□□ -1
HDA3Q06623 TMA23YMR269W 636 nt8.79□□□□□ -1
HDA3Q06623 YNR048WYNR048W 1182 nt8.79□□□□□ -1
HDA3Q06623 ERG13YML126C 1476 nt8.78□□□□□ -1
HDA3Q06623 YHL044WYHL044W 708 nt8.78□□□□□ -1
HDA3Q06623 YOR169CYOR169C 465 nt8.78□□□□□ -1
HDA3Q06623 YHR054CYHR054C 1065 nt8.77□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 ARR1YPR199C 885 nt8.77□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 SLX1YBR228W 915 nt8.77□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 SPR1YOR190W 1338 nt8.77□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 DLD3YEL071W 1491 nt8.77□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 PAU15YIR041W 375 nt8.76□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 MSA2YKR077W 1092 nt8.76□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 HDA1YNL021W 2121 nt8.76□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 YNL319WYNL319W 441 nt8.76□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 HMG2YLR450W 3138 nt8.75□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 MAK32YCR019W 1092 nt8.75□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 LSR1LSR1 1175 nt8.75□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 ODC1YPL134C 933 nt8.75□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 TAZ1YPR140W 1146 nt8.75□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 ITR2YOL103W 1830 nt8.74□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 SSL2YIL143C 2532 nt8.73□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 YEL008WYEL008W 381 nt8.73□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 TPO4YOR273C 1980 nt8.72□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 IMO32YGR031W 1029 nt8.72□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 OMA1YKR087C 1038 nt8.72□□□□□ -1.01
HDA3Q06623 VAM3YOR106W 852 nt8.72□□□□□ -1.01
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