Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABPB1Q06547 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GABPB1Q06547 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPB1Q06547 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABPB1Q06547 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABPB1Q06547 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABPB1Q06547 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPB1Q06547 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms