Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 TBX2-AS1-205ENST00000592009 330 ntTSL 321.78■■□□□ 1.086e-7■■■■□ 25.8
FKBP4Q02790 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.016e-7■■■■□ 25.8
FKBP4Q02790 CAPRIN2-213ENST00000542550 770 ntTSL 333.87■■■■□ 3.017e-7■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 CAPRIN2-211ENST00000540584 569 ntTSL 429.91■■■□□ 2.387e-7■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 CAPRIN2-215ENST00000546129 501 ntTSL 427.72■■■□□ 2.037e-7■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 CAPRIN2-212ENST00000541765 630 ntTSL 527.62■■■□□ 2.017e-7■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 CAPRIN2-210ENST00000540436 557 ntTSL 325.29■■□□□ 1.647e-7■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 CAPRIN2-207ENST00000537108 2187 ntTSL 510.08□□□□□ -0.87e-7■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.94e-6■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.74e-6■■■■□ 25.7
FKBP4Q02790 CTDSP1-213ENST00000496785 460 ntTSL 524.38■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 25.6
FKBP4Q02790 CTDSP1-203ENST00000431127 586 ntTSL 322.04■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 25.6
FKBP4Q02790 CTDSP1-202ENST00000428361 842 ntTSL 520.18■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 25.6
FKBP4Q02790 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 538.76■■■■□ 3.81e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.351e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 233.31■■■□□ 2.921e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 RNF126-205ENST00000591394 733 ntTSL 228.78■■■□□ 2.21e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 224.67■■□□□ 1.541e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 25.5
FKBP4Q02790 CTAGE5-216ENST00000556990 568 ntTSL 418.46■□□□□ 0.553e-9■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-9■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.33e-9■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-9■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SNAPC3-203ENST00000421710 730 ntTSL 532.1■■■□□ 2.737e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.77e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SCAMP4-210ENST00000588555 1785 nt31.53■■■□□ 2.647e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.537e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KEAP1-207ENST00000591039 960 ntTSL 330.52■■■□□ 2.487e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KEAP1-208ENST00000591419 986 ntTSL 328.77■■■□□ 2.27e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.187e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-203ENST00000437402 563 ntTSL 528.56■■■□□ 2.167e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-213ENST00000482138 588 ntTSL 426.85■■□□□ 1.897e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-212ENST00000481126 389 ntTSL 226.85■■□□□ 1.897e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-215ENST00000493074 627 ntTSL 426.85■■□□□ 1.897e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-204ENST00000454495 603 ntTSL 326.54■■□□□ 1.847e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.797e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.717e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 525.42■■□□□ 1.667e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.627e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-206ENST00000461813 587 ntTSL 425.09■■□□□ 1.617e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-202ENST00000427201 562 ntTSL 425.09■■□□□ 1.617e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.67e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.537e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-209ENST00000473045 542 ntTSL 424.43■■□□□ 1.57e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.477e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.477e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.467e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-213ENST00000528713 1202 ntTSL 1 (best)24.1■■□□□ 1.457e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KEAP1-209ENST00000592055 979 ntTSL 323.93■■□□□ 1.427e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KEAP1-203ENST00000585845 774 ntTSL 523.73■■□□□ 1.397e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-208ENST00000468101 574 ntTSL 423.19■■□□□ 1.37e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.237e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 522.59■■□□□ 1.217e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 322.19■■□□□ 1.147e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.137e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SNAPC3-206ENST00000490969 2524 ntTSL 1 (best)21.98■■□□□ 1.117e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.087e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SCAMP4-204ENST00000414057 1477 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.087e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 521.38■■□□□ 1.017e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.017e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.987e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SNAPC3-205ENST00000467062 2574 ntTSL 1 (best)20.97■□□□□ 0.957e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ZBED5-205ENST00000526852 789 ntTSL 420.86■□□□□ 0.937e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SCAMP4-205ENST00000452128 718 ntTSL 220.64■□□□□ 0.897e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-212ENST00000527485 873 ntTSL 220.38■□□□□ 0.857e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-215ENST00000529306 870 ntTSL 320.38■□□□□ 0.857e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-210ENST00000475827 545 ntTSL 420.24■□□□□ 0.837e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.827e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.797e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ZBED5-204ENST00000526020 1512 ntTSL 1 (best)19.81■□□□□ 0.767e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-214ENST00000529115 855 ntTSL 319.72■□□□□ 0.757e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.77e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-218ENST00000531149 709 ntTSL 319.27■□□□□ 0.687e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.677e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.667e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.637e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SCAMP4-206ENST00000460767 569 ntTSL 418.2■□□□□ 0.57e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.497e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 AP1M1-214ENST00000591966 542 ntTSL 417.13■□□□□ 0.337e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-208ENST00000524780 1059 ntTSL 216.89■□□□□ 0.297e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.27e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ARHGEF10L-201ENST00000167825 3018 ntTSL 215.89■□□□□ 0.137e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.17e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.077e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ARHGEF10L-206ENST00000469726 4585 ntTSL 215.46■□□□□ 0.077e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.027e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-211ENST00000526295 488 ntTSL 314.92□□□□□ -0.027e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.167e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.177e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 SCAMP4-208ENST00000489554 573 ntTSL 313.56□□□□□ -0.247e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ZBED5-206ENST00000528289 586 ntTSL 413.38□□□□□ -0.277e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.337e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.377e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 AP1M1-204ENST00000586461 545 ntTSL 312.07□□□□□ -0.487e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 RNH1-221ENST00000532055 704 ntTSL 311.51□□□□□ -0.577e-6■■■■□ 25.4
FKBP4Q02790 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.87e-6■■■■□ 25.4
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 200.5 ms