Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PLCB3Q01970 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLCB3Q01970 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLCB3Q01970 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB3Q01970 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PLCB3Q01970 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms