Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MDM2Q00987 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MDM2Q00987 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MDM2Q00987 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MDM2Q00987 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MDM2Q00987 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MDM2Q00987 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MDM2Q00987 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms