Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL1Q00532 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL1Q00532 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDKL1Q00532 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDKL1Q00532 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms