Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK3Q00526 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK3Q00526 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK3Q00526 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK3Q00526 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK3Q00526 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms