Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3AP98173 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM3AP98173 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM3AP98173 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM3AP98173 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms