Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P63124 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P63124 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P63124 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERV-K104P63124 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HERV-K104P63124 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERV-K104P63124 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERV-K104P63124 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P63124 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERV-K104P63124 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms