Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA52P62987 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA52P62987 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA52P62987 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA52P62987 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA52P62987 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA52P62987 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA52P62987 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA52P62987 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA52P62987 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA52P62987 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA52P62987 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA52P62987 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA52P62987 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA52P62987 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA52P62987 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA52P62987 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBA52P62987 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA52P62987 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA52P62987 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA52P62987 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA52P62987 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA52P62987 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA52P62987 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA52P62987 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA52P62987 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA52P62987 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA52P62987 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA52P62987 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA52P62987 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA52P62987 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA52P62987 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA52P62987 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA52P62987 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA52P62987 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA52P62987 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA52P62987 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA52P62987 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA52P62987 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA52P62987 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA52P62987 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA52P62987 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA52P62987 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA52P62987 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA52P62987 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA52P62987 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA52P62987 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA52P62987 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA52P62987 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA52P62987 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA52P62987 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA52P62987 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA52P62987 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA52P62987 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA52P62987 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA52P62987 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBA52P62987 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA52P62987 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA52P62987 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA52P62987 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBA52P62987 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA52P62987 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA52P62987 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA52P62987 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA52P62987 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA52P62987 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA52P62987 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA52P62987 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA52P62987 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA52P62987 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA52P62987 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA52P62987 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA52P62987 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA52P62987 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA52P62987 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA52P62987 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA52P62987 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA52P62987 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA52P62987 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA52P62987 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA52P62987 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA52P62987 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA52P62987 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA52P62987 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA52P62987 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA52P62987 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA52P62987 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA52P62987 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA52P62987 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA52P62987 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA52P62987 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA52P62987 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA52P62987 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms