Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRP54P61011 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRP54P61011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRP54P61011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRP54P61011 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRP54P61011 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRP54P61011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRP54P61011 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRP54P61011 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRP54P61011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRP54P61011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRP54P61011 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP54P61011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRP54P61011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP54P61011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRP54P61011 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRP54P61011 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP54P61011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP54P61011 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRP54P61011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP54P61011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP54P61011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRP54P61011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP54P61011 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP54P61011 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRP54P61011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRP54P61011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP54P61011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP54P61011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRP54P61011 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP54P61011 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP54P61011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP54P61011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRP54P61011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRP54P61011 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP54P61011 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP54P61011 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP54P61011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP54P61011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP54P61011 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP54P61011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP54P61011 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP54P61011 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP54P61011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP54P61011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP54P61011 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP54P61011 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms