Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIPPLY3P57055 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIPPLY3P57055 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPPLY3P57055 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIPPLY3P57055 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIPPLY3P57055 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms