Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME5P56597 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME5P56597 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME5P56597 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME5P56597 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME5P56597 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME5P56597 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NME5P56597 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME5P56597 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME5P56597 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME5P56597 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME5P56597 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME5P56597 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME5P56597 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME5P56597 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME5P56597 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME5P56597 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME5P56597 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME5P56597 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME5P56597 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NME5P56597 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NME5P56597 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME5P56597 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME5P56597 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME5P56597 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME5P56597 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME5P56597 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME5P56597 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME5P56597 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME5P56597 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME5P56597 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME5P56597 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME5P56597 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME5P56597 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME5P56597 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME5P56597 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME5P56597 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME5P56597 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME5P56597 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME5P56597 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME5P56597 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NME5P56597 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME5P56597 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME5P56597 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME5P56597 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME5P56597 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME5P56597 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME5P56597 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME5P56597 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME5P56597 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME5P56597 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME5P56597 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME5P56597 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME5P56597 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NME5P56597 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME5P56597 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME5P56597 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME5P56597 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NME5P56597 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME5P56597 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NME5P56597 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NME5P56597 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
NME5P56597 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME5P56597 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME5P56597 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME5P56597 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME5P56597 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME5P56597 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME5P56597 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME5P56597 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME5P56597 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME5P56597 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME5P56597 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME5P56597 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME5P56597 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME5P56597 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME5P56597 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME5P56597 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME5P56597 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME5P56597 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME5P56597 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NME5P56597 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME5P56597 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME5P56597 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME5P56597 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME5P56597 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME5P56597 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME5P56597 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME5P56597 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME5P56597 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME5P56597 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME5P56597 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME5P56597 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms