Protein–RNA interactions for Protein: P51513

NOVA1, RNA-binding protein Nova-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA1P51513 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOVA1P51513 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOVA1P51513 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOVA1P51513 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOVA1P51513 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOVA1P51513 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOVA1P51513 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA1P51513 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms