Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK7P50613 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK7P50613 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK7P50613 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK7P50613 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK7P50613 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK7P50613 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK7P50613 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK7P50613 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK7P50613 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK7P50613 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK7P50613 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK7P50613 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK7P50613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK7P50613 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK7P50613 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK7P50613 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK7P50613 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK7P50613 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK7P50613 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK7P50613 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDK7P50613 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK7P50613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK7P50613 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK7P50613 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK7P50613 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK7P50613 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK7P50613 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDK7P50613 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK7P50613 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDK7P50613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK7P50613 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDK7P50613 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK7P50613 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK7P50613 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK7P50613 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK7P50613 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDK7P50613 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK7P50613 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDK7P50613 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK7P50613 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK7P50613 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDK7P50613 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK7P50613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK7P50613 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK7P50613 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK7P50613 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDK7P50613 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK7P50613 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDK7P50613 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK7P50613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK7P50613 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK7P50613 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK7P50613 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDK7P50613 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK7P50613 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK7P50613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK7P50613 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK7P50613 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK7P50613 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK7P50613 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK7P50613 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK7P50613 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK7P50613 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK7P50613 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK7P50613 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK7P50613 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK7P50613 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK7P50613 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK7P50613 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK7P50613 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK7P50613 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK7P50613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK7P50613 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK7P50613 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK7P50613 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK7P50613 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK7P50613 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK7P50613 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK7P50613 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK7P50613 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK7P50613 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK7P50613 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK7P50613 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK7P50613 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK7P50613 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK7P50613 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDK7P50613 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDK7P50613 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDK7P50613 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK7P50613 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK7P50613 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK7P50613 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDK7P50613 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK7P50613 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK7P50613 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK7P50613 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CDK7P50613 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK7P50613 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDK7P50613 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms