Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTDSS1P48651 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1P48651 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1P48651 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTDSS1P48651 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTDSS1P48651 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTDSS1P48651 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms