Protein–RNA interactions for Protein: P48060

GLIPR1, Glioma pathogenesis-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIPR1P48060 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLIPR1P48060 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLIPR1P48060 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLIPR1P48060 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GLIPR1P48060 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GLIPR1P48060 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GLIPR1P48060 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GLIPR1P48060 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GLIPR1P48060 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GLIPR1P48060 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLIPR1P48060 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms