Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ITGAEP38570 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.32■■■■□ 3.89
ITGAEP38570 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
ITGAEP38570 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ITGAEP38570 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
ITGAEP38570 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ITGAEP38570 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms