Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCVRNP35243 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCVRNP35243 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCVRNP35243 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCVRNP35243 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCVRNP35243 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCVRNP35243 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms