Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 PHB2YGR231C 933 nt7.81□□□□□ -1.16
SEF1P34228 YLR046CYLR046C 813 nt7.81□□□□□ -1.16
SEF1P34228 ADH3YMR083W 1128 nt7.81□□□□□ -1.16
SEF1P34228 RCR1YBR005W 642 nt7.81□□□□□ -1.16
SEF1P34228 SGA1YIL099W 1650 nt7.8□□□□□ -1.16
SEF1P34228 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.8□□□□□ -1.16
SEF1P34228 SPE2YOL052C 1191 nt7.8□□□□□ -1.16
SEF1P34228 DMA2YNL116W 1569 nt7.79□□□□□ -1.16
SEF1P34228 KES1YPL145C 1305 nt7.78□□□□□ -1.16
SEF1P34228 YRF1-2YER190W 5046 nt7.78□□□□□ -1.16
SEF1P34228 YNR064CYNR064C 873 nt7.78□□□□□ -1.16
SEF1P34228 MEX67YPL169C 1800 nt7.78□□□□□ -1.16
SEF1P34228 ZAP1YJL056C 2643 nt7.77□□□□□ -1.17
SEF1P34228 DLD3YEL071W 1491 nt7.76□□□□□ -1.17
SEF1P34228 PAB1YER165W 1734 nt7.76□□□□□ -1.17
SEF1P34228 HRA1HRA1 564 nt7.76□□□□□ -1.17
SEF1P34228 FSH2YMR222C 672 nt7.76□□□□□ -1.17
SEF1P34228 HTS1YPR033C 1641 nt7.75□□□□□ -1.17
SEF1P34228 CYC3YAL039C 810 nt7.75□□□□□ -1.17
SEF1P34228 YOR268CYOR268C 399 nt7.75□□□□□ -1.17
SEF1P34228 MFG1YDL233W 1377 nt7.74□□□□□ -1.17
SEF1P34228 YHR218WYHR218W 1812 nt7.74□□□□□ -1.17
SEF1P34228 MOB1YIL106W 945 nt7.74□□□□□ -1.17
SEF1P34228 GRH1YDR517W 1119 nt7.73□□□□□ -1.17
SEF1P34228 LPD1YFL018C 1500 nt7.73□□□□□ -1.17
SEF1P34228 GID8YMR135C 1368 nt7.72□□□□□ -1.17
SEF1P34228 TPC1YGR096W 945 nt7.72□□□□□ -1.17
SEF1P34228 ITR2YOL103W 1830 nt7.72□□□□□ -1.17
SEF1P34228 AMF1YOR378W 1548 nt7.72□□□□□ -1.17
SEF1P34228 SFL1YOR140W 2301 nt7.72□□□□□ -1.17
SEF1P34228 ALR1YOL130W 2580 nt7.71□□□□□ -1.18
SEF1P34228 ENO2YHR174W 1314 nt7.71□□□□□ -1.18
SEF1P34228 KEL3YPL263C 1956 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 NSG2YNL156C 900 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 YHR219WYHR219W 1875 nt7.7□□□□□ -1.18
SEF1P34228 ELO1YJL196C 933 nt7.69□□□□□ -1.18
SEF1P34228 VMA11YPL234C 495 nt7.69□□□□□ -1.18
SEF1P34228 UFD1YGR048W 1086 nt7.68□□□□□ -1.18
SEF1P34228 SWT21YNL187W 1074 nt7.68□□□□□ -1.18
SEF1P34228 MRS6YOR370C 1812 nt7.67□□□□□ -1.18
SEF1P34228 YKL133CYKL133C 1392 nt7.67□□□□□ -1.18
SEF1P34228 YGR210CYGR210C 1236 nt7.66□□□□□ -1.18
SEF1P34228 YKR012CYKR012C 378 nt7.66□□□□□ -1.18
SEF1P34228 ODC1YPL134C 933 nt7.66□□□□□ -1.18
SEF1P34228 LEU2YCL018W 1095 nt7.66□□□□□ -1.18
SEF1P34228 YMR265CYMR265C 1386 nt7.66□□□□□ -1.18
SEF1P34228 EDC2YER035W 438 nt7.65□□□□□ -1.18
SEF1P34228 NAS6YGR232W 687 nt7.65□□□□□ -1.18
SEF1P34228 SRP102YKL154W 735 nt7.65□□□□□ -1.18
SEF1P34228 LSR1LSR1 1175 nt7.65□□□□□ -1.18
SEF1P34228 HAP5YOR358W 729 nt7.65□□□□□ -1.18
SEF1P34228 SUV3YPL029W 2214 nt7.65□□□□□ -1.18
SEF1P34228 FCY1YPR062W 477 nt7.65□□□□□ -1.18
SEF1P34228 snR31snR31 225 nt7.64□□□□□ -1.19
SEF1P34228 NAM8YHR086W 1572 nt7.63□□□□□ -1.19
SEF1P34228 SDS24YBR214W 1584 nt7.63□□□□□ -1.19
SEF1P34228 RPN14YGL004C 1254 nt7.63□□□□□ -1.19
SEF1P34228 EMC3YKL207W 762 nt7.63□□□□□ -1.19
SEF1P34228 ERO1YML130C 1692 nt7.63□□□□□ -1.19
SEF1P34228 TOS1YBR162C 1368 nt7.62□□□□□ -1.19
SEF1P34228 RPD3YNL330C 1302 nt7.62□□□□□ -1.19
SEF1P34228 CWP2YKL096W-A 279 nt7.62□□□□□ -1.19
SEF1P34228 THI6YPL214C 1623 nt7.62□□□□□ -1.19
SEF1P34228 MET1YKR069W 1782 nt7.61□□□□□ -1.19
SEF1P34228 HOG1YLR113W 1308 nt7.61□□□□□ -1.19
SEF1P34228 YMR206WYMR206W 942 nt7.61□□□□□ -1.19
SEF1P34228 AAC3YBR085W 924 nt7.61□□□□□ -1.19
SEF1P34228 MRP1YDR347W 966 nt7.6□□□□□ -1.19
SEF1P34228 YJL160CYJL160C 864 nt7.6□□□□□ -1.19
SEF1P34228 SNX3YOR357C 489 nt7.6□□□□□ -1.19
SEF1P34228 HXT10YFL011W 1641 nt7.6□□□□□ -1.19
SEF1P34228 SSL2YIL143C 2532 nt7.59□□□□□ -1.19
SEF1P34228 VBA3YCL069W 1377 nt7.59□□□□□ -1.19
SEF1P34228 YLR173WYLR173W 1827 nt7.59□□□□□ -1.19
SEF1P34228 RTG2YGL252C 1767 nt7.59□□□□□ -1.19
SEF1P34228 KRR1YCL059C 951 nt7.59□□□□□ -1.19
SEF1P34228 YLR280CYLR280C 351 nt7.59□□□□□ -1.19
SEF1P34228 CRC1YOR100C 984 nt7.59□□□□□ -1.19
SEF1P34228 ENO1YGR254W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
SEF1P34228 KAE1YKR038C 1161 nt7.58□□□□□ -1.2
SEF1P34228 YPL108WYPL108W 507 nt7.58□□□□□ -1.2
SEF1P34228 FIT1YDR534C 1587 nt7.58□□□□□ -1.2
SEF1P34228 REX2YLR059C 810 nt7.57□□□□□ -1.2
SEF1P34228 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 YKL053WYKL053W 375 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 YMR210WYMR210W 1350 nt7.55□□□□□ -1.2
SEF1P34228 SRP54YPR088C 1626 nt7.53□□□□□ -1.2
SEF1P34228 SAN1YDR143C 1833 nt7.53□□□□□ -1.2
SEF1P34228 DUR3YHL016C 2208 nt7.52□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.5 ms