Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GBP1P32455 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP1P32455 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP1P32455 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP1P32455 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GBP1P32455 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP1P32455 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP1P32455 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GBP1P32455 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP1P32455 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP1P32455 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP1P32455 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GBP1P32455 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GBP1P32455 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GBP1P32455 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP1P32455 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP1P32455 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP1P32455 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP1P32455 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP1P32455 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP1P32455 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP1P32455 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP1P32455 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP1P32455 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP1P32455 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP1P32455 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP1P32455 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP1P32455 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP1P32455 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP1P32455 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP1P32455 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP1P32455 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP1P32455 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP1P32455 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP1P32455 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP1P32455 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP1P32455 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP1P32455 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GBP1P32455 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP1P32455 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP1P32455 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP1P32455 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP1P32455 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP1P32455 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP1P32455 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP1P32455 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP1P32455 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP1P32455 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP1P32455 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP1P32455 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP1P32455 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP1P32455 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP1P32455 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP1P32455 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP1P32455 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP1P32455 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP1P32455 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP1P32455 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP1P32455 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP1P32455 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP1P32455 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP1P32455 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP1P32455 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP1P32455 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP1P32455 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP1P32455 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP1P32455 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP1P32455 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP1P32455 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP1P32455 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP1P32455 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP1P32455 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP1P32455 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP1P32455 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP1P32455 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP1P32455 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP1P32455 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP1P32455 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP1P32455 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP1P32455 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP1P32455 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP1P32455 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP1P32455 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP1P32455 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP1P32455 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP1P32455 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP1P32455 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP1P32455 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP1P32455 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP1P32455 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP1P32455 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP1P32455 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP1P32455 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP1P32455 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP1P32455 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP1P32455 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP1P32455 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP1P32455 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP1P32455 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GBP1P32455 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms