Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPOP30536 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPOP30536 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPOP30536 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPOP30536 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPOP30536 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPOP30536 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPOP30536 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPOP30536 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPOP30536 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPOP30536 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPOP30536 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSPOP30536 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPOP30536 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPOP30536 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPOP30536 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPOP30536 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPOP30536 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPOP30536 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPOP30536 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPOP30536 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPOP30536 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPOP30536 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPOP30536 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPOP30536 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPOP30536 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPOP30536 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPOP30536 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPOP30536 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPOP30536 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPOP30536 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPOP30536 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPOP30536 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPOP30536 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPOP30536 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPOP30536 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPOP30536 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPOP30536 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPOP30536 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPOP30536 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPOP30536 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPOP30536 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPOP30536 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPOP30536 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPOP30536 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPOP30536 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPOP30536 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPOP30536 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPOP30536 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPOP30536 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPOP30536 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPOP30536 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TSPOP30536 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TSPOP30536 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TSPOP30536 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TSPOP30536 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TSPOP30536 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TSPOP30536 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TSPOP30536 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TSPOP30536 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TSPOP30536 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TSPOP30536 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPOP30536 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPOP30536 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPOP30536 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPOP30536 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPOP30536 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPOP30536 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPOP30536 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPOP30536 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPOP30536 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPOP30536 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPOP30536 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPOP30536 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPOP30536 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPOP30536 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPOP30536 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPOP30536 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPOP30536 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPOP30536 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPOP30536 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSPOP30536 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSPOP30536 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSPOP30536 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSPOP30536 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSPOP30536 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms