Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGA1P29973 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNGA1P29973 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGA1P29973 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNGA1P29973 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNGA1P29973 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CNGA1P29973 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms