Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CANXP27824 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CANXP27824 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CANXP27824 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CANXP27824 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CANXP27824 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CANXP27824 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CANXP27824 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CANXP27824 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CANXP27824 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CANXP27824 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CANXP27824 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CANXP27824 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CANXP27824 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CANXP27824 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CANXP27824 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CANXP27824 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CANXP27824 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CANXP27824 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CANXP27824 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CANXP27824 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CANXP27824 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CANXP27824 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CANXP27824 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CANXP27824 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CANXP27824 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CANXP27824 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CANXP27824 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CANXP27824 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CANXP27824 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CANXP27824 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CANXP27824 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CANXP27824 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CANXP27824 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CANXP27824 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CANXP27824 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CANXP27824 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CANXP27824 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CANXP27824 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CANXP27824 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CANXP27824 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CANXP27824 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CANXP27824 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CANXP27824 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CANXP27824 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CANXP27824 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CANXP27824 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CANXP27824 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CANXP27824 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CANXP27824 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CANXP27824 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CANXP27824 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CANXP27824 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CANXP27824 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CANXP27824 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CANXP27824 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CANXP27824 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CANXP27824 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CANXP27824 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CANXP27824 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CANXP27824 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CANXP27824 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CANXP27824 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CANXP27824 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CANXP27824 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CANXP27824 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CANXP27824 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CANXP27824 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CANXP27824 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CANXP27824 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CANXP27824 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CANXP27824 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CANXP27824 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CANXP27824 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CANXP27824 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CANXP27824 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CANXP27824 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CANXP27824 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CANXP27824 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CANXP27824 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CANXP27824 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CANXP27824 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CANXP27824 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CANXP27824 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CANXP27824 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CANXP27824 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CANXP27824 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CANXP27824 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CANXP27824 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CANXP27824 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CANXP27824 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CANXP27824 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CANXP27824 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CANXP27824 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CANXP27824 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CANXP27824 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CANXP27824 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CANXP27824 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CANXP27824 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CANXP27824 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms