Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VARSP26640 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARSP26640 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARSP26640 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VARSP26640 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VARSP26640 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARSP26640 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARSP26640 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VARSP26640 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VARSP26640 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VARSP26640 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VARSP26640 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARSP26640 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VARSP26640 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VARSP26640 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VARSP26640 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARSP26640 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARSP26640 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VARSP26640 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARSP26640 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VARSP26640 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VARSP26640 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VARSP26640 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARSP26640 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARSP26640 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARSP26640 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARSP26640 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VARSP26640 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VARSP26640 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VARSP26640 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VARSP26640 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VARSP26640 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VARSP26640 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VARSP26640 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VARSP26640 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VARSP26640 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VARSP26640 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VARSP26640 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VARSP26640 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VARSP26640 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VARSP26640 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VARSP26640 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VARSP26640 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VARSP26640 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VARSP26640 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VARSP26640 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VARSP26640 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VARSP26640 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VARSP26640 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VARSP26640 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VARSP26640 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VARSP26640 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VARSP26640 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VARSP26640 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VARSP26640 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VARSP26640 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VARSP26640 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VARSP26640 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VARSP26640 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VARSP26640 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VARSP26640 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VARSP26640 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VARSP26640 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VARSP26640 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VARSP26640 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VARSP26640 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VARSP26640 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VARSP26640 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VARSP26640 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VARSP26640 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VARSP26640 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VARSP26640 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VARSP26640 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VARSP26640 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VARSP26640 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VARSP26640 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VARSP26640 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VARSP26640 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VARSP26640 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VARSP26640 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VARSP26640 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VARSP26640 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VARSP26640 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VARSP26640 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VARSP26640 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms