Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRDP23468 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRDP23468 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRDP23468 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRDP23468 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRDP23468 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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