Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACO1P21399 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACO1P21399 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACO1P21399 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACO1P21399 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACO1P21399 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ACO1P21399 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ACO1P21399 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACO1P21399 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACO1P21399 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACO1P21399 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACO1P21399 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACO1P21399 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACO1P21399 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACO1P21399 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ACO1P21399 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACO1P21399 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACO1P21399 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACO1P21399 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACO1P21399 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACO1P21399 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACO1P21399 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACO1P21399 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACO1P21399 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACO1P21399 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACO1P21399 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACO1P21399 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACO1P21399 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACO1P21399 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACO1P21399 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACO1P21399 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACO1P21399 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACO1P21399 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACO1P21399 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACO1P21399 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACO1P21399 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACO1P21399 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACO1P21399 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACO1P21399 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACO1P21399 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACO1P21399 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACO1P21399 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACO1P21399 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACO1P21399 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACO1P21399 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACO1P21399 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACO1P21399 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACO1P21399 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACO1P21399 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACO1P21399 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACO1P21399 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACO1P21399 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACO1P21399 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACO1P21399 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACO1P21399 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACO1P21399 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ACO1P21399 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACO1P21399 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACO1P21399 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACO1P21399 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACO1P21399 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACO1P21399 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACO1P21399 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACO1P21399 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACO1P21399 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACO1P21399 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACO1P21399 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACO1P21399 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACO1P21399 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACO1P21399 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACO1P21399 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACO1P21399 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACO1P21399 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ACO1P21399 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACO1P21399 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACO1P21399 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACO1P21399 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ACO1P21399 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ACO1P21399 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACO1P21399 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACO1P21399 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACO1P21399 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACO1P21399 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACO1P21399 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACO1P21399 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ACO1P21399 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACO1P21399 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACO1P21399 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACO1P21399 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACO1P21399 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACO1P21399 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACO1P21399 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACO1P21399 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACO1P21399 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACO1P21399 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ACO1P21399 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACO1P21399 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ACO1P21399 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ACO1P21399 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ACO1P21399 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms